公元2035年，人類被12只猴子軍研制的一種病毒侵襲，大部分人類都在這場(chǎng)病毒災(zāi)難中死亡，只有少數(shù)人僥幸逃生，但也只能在陰暗的地下，茍且偷生。　　科學(xué)家們決定派人穿越時(shí)光回到1996年追查12只猴子軍的來(lái)歷。囚徒詹姆斯·科爾(布魯斯·威利斯 Bruce Willis 飾)被 挑選為志愿者。陰差陽(yáng)錯(cuò)，科爾回到了1990年，當(dāng)他向當(dāng)時(shí)的人們描述未來(lái)的那場(chǎng)大災(zāi)難時(shí)，被當(dāng)作精神病捉了起來(lái)并被醫(yī)生凱瑟琳·雪莉（瑪?shù)铝铡に雇?Madeleine Stowe 飾）診斷為精神分裂癥。科爾在病友杰弗里·戈因斯幫助下逃脫，回到了未來(lái)。因?yàn)闆](méi)查清12只猴子軍的來(lái)歷，科爾再次被派回了1996年。　　科爾這次發(fā)現(xiàn)了12只猴子軍的起源地在費(fèi)城，他找到了醫(yī)生凱瑟琳，二人一起展開(kāi)了追查12只猴子軍的冒險(xiǎn)之旅!